PORTAL Información y divulgación #COVID-19 Uruguay

Los recursos humanos formados en diferentes áreas de la ciencia son muy importantes para el país. No permiten contar con ciudadanos con una formación determinada que pueden ayudar a comprender gráficas, procesos, o buscar información veraz para responder a las preguntas que nos hacemos todos.

Por eso creamos el portal “Información y Divulgación #COVID-19” donde un grupo de investigadores y una especialista en comunicación científica del IIBCE se encargan de buscar los mejores contenidos desde páginas oficiales y revistas científicas revisadas por pares.

Allí pueden hacernos su pregunta y les contestamos personalmente a la mayor brevedad. Es aquí donde buscamos la información científica, leemos los artículos y formulamos una respuesta. 

Brindamos información básica y una sección de preguntas frecuentes donde la gente puede profundizar sus conocimientos y plantear dudas referentes a un tema específico. Vale la pena destacar que la web tiene el objetivo de brindar información para el público general, además del personal especializado en el área científica, médica u otras más vinculadas con el combate a la pandemia.

Por último, en la secciones recursos confiables y en cuarentena recomendamos portales y contenidos seguros que pueden ser útiles para que tanto niños como adultos enfrenten la cuarentena aprendiendo y jugando. Allí también les recomendamos nuestra lista en youtube sobre COVID19, con contenidos creados especialmente por investigadores del Instituto para compartir la ciencia del COVID19 en forma clara y segura.

Nuestro Instituto ante el COVID-19

Nuestro Instituto está trabajando para sumarse al esfuerzo de todo el país en revertir la situación sanitaria debida a la pandemia del COVID19.

Con este fin,  hemos creado la Comisión Institucional COVID-19 que coordina nuestras acciones  a la que se ha integrado el Dr. Eduardo de Mello Volotão, investigador de la Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz, Brasil) y participante en actividades de referencia para la Organización Mundial de la Salud y Organización Panamericana de la Salud en prevención de enfermedades virales.

Integramos la red de instituciones académicas junto con UDELAR, el IP y el INIA donde trabajamos junto al MSP para coordinar el apoyo con instalaciones, insumos y personal especializado para, entre otras acciones:

  1. colaborar con el diagnóstico. Contamos con decenas de investigadores con experiencia calificada que se han ofrecido como voluntarios
  2. secuenciar las variantes del genoma del SARS-Cov-2 circulantes en el país.
    En este sentido nos sumamos con recursos humanos especializados, fondos propios y la plataforma institucional de secuenciación masiva que cuenta con equipamiento de última generación (Ion S5) capaz de lograr grandes números de secuencias de genomas virales con una alta resolución y en poco tiempo.

El IIBCE también combina esfuerzos con el sector privado, en este caso, con empresa ATGEN para mejorar de capacidad de detección e investigación en temas vinculados a coronavirus y COVID-19, en el marco de un convenio avalado por el MEC. Allí están trabajando 4 investigadoras de los Departamentos de Microbiología y Biología Molecular: Sofía Fernández, Gabriela Martínez de la Escalera, Eilyn Mena y Maria Fernanda Trovero respectivamente.

Además de estas acciones, hemos creado un canal de comunicación abierto y directo para consultas, con información actualizada, segura y confiable, además de contenidos de divulgación. Todos los contenidos son revisados por investigadoras e investigadores.

Y para los audiovisuales sobre COVID, creamos una lista especial en nuestro canal de Youtube.

Compartimos la entrevista en SobreCiencia a nuestro Presidente, Pablo Zunino, donde cuenta con más detalle nuestras acciones.

Instituciones científicas trabajan coordinadas sobre covid-19

Talleres de aproximación a la investigación en el Día Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia > #11F

El 11 de febrero les esperamos para celebrar con nosotros el Día Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia. Se trata de una invitación especial para conocer nuestro Instituto y descubrir cómo hacemos #investigación en el taller de campo para niñas exploradoras y el #taller de microscopía 😃🦗🔍📝🕷🤯🤗🐟

El #11F es un “Día de” que valoramos mucho, declarado por UNESCO en 2015 para impulsar el trabajo de las mujeres en el ámbito científico y destacar el rol clave que juegan en su desarrollo a nivel global, desde hace muchísimos años.

El Instituto se suma una vez más a esta celebración que cada vez cobra más fuerza💪🏾👩‍🦳
Este año lo c
elebraremos en familia, por más ciencia en la cultura y más mujeres en la ciencia.

La cita es a las 16:00 para el taller de Microscopía y a las 17:00 para el de Exploración.
Por más detalles consultar directamente a las responsables de cada taller:

1 > Taller de campo para niñas exploradoras

La actividad consiste en un taller para que las niñas se familiaricen con técnicas de muestreo para identificar la fauna de arácnidos e insectos y su importancia para la conservación de la biodiversidad. Recientes estudios dejan en evidencia que estamos frente a una crisis mundial en la biodiversidad. Por esto es muy importante conocer nuestra fauna, particularmente aquellos grupos que tradicionalmente han quedado de lado. 

Responsable Anita Aisenberg – anita.aisenberg@gmail.com

2 > Taller de microscopía

En el taller intercambiamos reflexiones y expectativas en torno al “micromundo”, para luego poner las manos en la masa y manipular microscopios especialmente diseñados para la ocasión. Puntualmente, trabajamos con 2 tipos de microscopios “caseros” de bajo costo: los de armado fácil tipo bricolaje (Figura 1) y los Foldscopes o microscopios de cartón troquelado de tipo “origami”con lente única (Figura 2). Para ambos casos, los prototipos de armado están disponibles en internet y los materiales pueden conseguirse en las ferreterías. Por último, se utilizan instrumentos de microscopía disponibles en los laboratorios del IIBCE. También visitamos y conocemos cómo funcionan los microscopios del Instituto.

Responsable Marita Castelló, contacto con Sofía Ramundey sramundey@gmail.com


*Si desean consultar por teléfono pueden llamar a portería y pedir con alguna de las responsables el 24871616 

*El #11F se celebra a nivel local, regional y global, con actividades de divulgación super variadas y una fuerte presencia en redes sociales, donde a través de las etiquetas por ej. #mujeresenciencia #diamujeryniñaenciencia #11F #11f2020 #11defebrero #mujeryniñaenciencia #mujeryniñaenlaciencia #WomenInScience se encuentran historias de mujeres científicas de todos los tiempos, convocatorias, materiales didácticos, estudios académicos y reflexiones profundas sobre la equidad de género en la ciencia.

Les invitamos también a sumarse a la celebración en línea 😀

 

IIBCE investiga y desarrolla metodologías innovadoras para detectar múltiples patógenos en una sola muestra de agua

En el Instituto contamos con una Plataforma de *Secuenciación Masiva con equipamiento de última generación que permite leer grandes cantidades de información contenida en el ADN. 

Dentro del proyecto Generación de un método basado en secuenciación genómica masiva para detectar microorganismos nocivos en muestras de agua y utilizando este equipamiento, en el Departamento de Genómica hemos desarrollado una metodología innovadora para detectar patógenos en aguas más rápida y precisa que los métodos convencionales.

Para ello, analizamos la información genética asociada a las enfermedades o sustancias tóxicas que producen estos patógenos, agrupada en “factores de virulencia”. Esto es posible a través de la amplificación de múltiples genes de virulencia y su posterior secuenciación masiva. 

Antes de analizar las muestras, se preparan junto a los instrumentos en esta cabina de radiación UV, que no permite la presencia de ADN extraño. Así, se evita cualquier tipo de contaminación de las muestras.

El equipo de trabajo del proyecto, financiado por la ANII con los Fondos María Viñas, está formado por Álvaro González Revello, Claudia Piccini, Andrés Iriarte y liderado por José Sotelo-Silveira.

Los investigadores seleccionaron 72 factores de virulencia vinculados a bacterias patógenas de alto riesgo para la salud, que pertenecen a más de 50 especies distintas como Escherichia coli, Salmonella, Lysteria o Vibrio cholerae. Como resultado, con esta técnica es posible detectar hasta 72 patógenos diferentes en un único ensayo. Un ejemplo es la detección de los genes vinculados a varias toxinas que producen las #cianobacterias que proliferan en los sistemas acuáticos de nuestro país. 

Este proyecto y varios otros que utilizan los servicios de la Plataforma de secuenciación masiva no serían posibles sin la técnica responsable, Mag. Cecilia Mathó.

Actual y tradicionalmente, la detección de patógenos en aguas se realiza cultivando los microorganismos y realizando ensayos específicos para cada uno. Esta nueva metodología, además de ser altamente sensible e incluir una serie de patógenos para los que no existían métodos de detección estandarizados, permite analizar varias muestras en simultáneo en un tiempo relativamente corto.

Los avances en los métodos de secuenciación genética permiten un análisis paralelo masivo de secuencias de ADN provenientes de muestras ambientales y abren una nueva era de desarrollo para la evaluación de la calidad del agua.

Este equipo pequeño pero muy potente, amplifica las regiones de ADN provenientes de las muestras de aguas a analizar. Esto es un paso previo a cualquier secuenciación, ya que se necesitan grandes cantidades idénticas de una región genética para poder identificar regiones clave..

Este equipo pequeño pero muy potente, amplifica las regiones de ADN provenientes de las muestras de aguas a analizar. Esto es un paso previo a cualquier secuenciación, ya que se necesitan grandes cantidades idénticas de una región genética para poder identificar regiones clave..

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*La secuenciación genómica masiva es también conocida como secuenciación de segunda generación o “Next Generation Sequencing” (NGS).

Micropasantías 2019 en el IIBCE – Estudiantes de bachillerato investigaron junto a investigadores del Instituto

A partir de un convenio entre ANEP – Administración Nacional de Educación Pública y el PEDECIBA – Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas, en 2019 hemos realizando varias micropasantías con estudiantes de Bachillerato de diferentes puntos del país.

Se trata de instancias cortas de investigación donde los jóvenes participan en algunos de nuestros laboratorios por unos días, y de esta manera, además de colaborar y aprender un montón con nosotros, conocen cómo trabajamos.

El objetivo principal de estas instancias es motivar a las y los jóvenes a incursionar en el mundo de las Ciencias. Están dirigidas a estudiantes del Consejo de Educación Secundaria y del Consejo de Educación Técnico Profesional, que son seleccionados por un llamado abierto para participar.

Nuestro Instituto presentó varias propuestas de trabajo desde las 4 grandes áreas de investigación que desarrolla, y afortunadamente todas ellas fueron llevadas a cabo.
Les contamos algunas de las que hemos realizado: 

En el Departamento de Neurociencias integrativas y computacionales, junto al investigador Angel Caputti, 5 estudiantes exploraron sobre la propuesta: Evaluación de la respuesta de novedad, del pez al hombre

2 estudiantes se preparan para medir las respuestas cerebrales frente a un estímulo repetitivo y un cambio de estímulo repentino

Durante esta experiencia y mediante varios exámenes sencillos observaron la forma en que los seres vivos respondemos a estímulos sensoriales novedosos

Para ello, primero utilizaron un pez eléctrico  y midieron su respuesta biológica frente a un estímulo recurrente y un cambio repentino. Allí vieron que frente al estímulo nuevo los intervalos de los pulsos eléctricos emitidos por el pez se acortaban. 

En una segunda instancia midieron la respuesta de un individuo humano ¡con uno de los propios pasantes! quien recibió estímulos iguales en forma sucesiva hasta que se topó con uno diferente; en ese momento observaron un cambio en la actividad cerebral como respuesta al cambio de estímulo.

La investigadora María E. Castelló del Laboratorio de Desarrollo Neural también llevó a cabo junto a 2 estudiantes otra propuesta en Neurociencias vinculada a la observación de los sitios donde se generan nuevas neuronas en los peces eléctricos de nuestro país*. Durante esta pasantía los estudiantes utilizaron un pez autóctono en etapa adulta de la especie Gymnotus omarorum, también llamada comúnmente morena pintada, para reconocer las células neurales y las zonas donde se multiplicaron en el microscopio de fluorescencia confocal .

En el Departamento de Ecología Evolutiva realizaron al menos 2 pasantías. Una de ellas con el investigador Rodrigo Postiglioni, motivada por los estudios recientes que evidencian una crisis mundial en la biodiversidad. Su propuesta se tituló: Arácnidos e insectos: explorando la biodiversidad de un mundo desconocido y consideró de mucha importancia plantear una acción para conocer nuestra fauna, en especial aquellos grupos rezagados.

Para eso los 3 estudiantes que participaron probaron 3 técnicas de muestreo para recolectar arácnidos e insectos: red de entomología, captura manual y paraguas japonés. Trabajaron sobre las características generales de los grupos, dónde buscarlos, cómo hacerlo, además de abordar estudios comportamentales, ecológicos y genéticos en un marco evolutivo.

Colectando insectos con 3 técnicas diferentes en el patio del Instituto.

Estudiantes realizando la colecta manual de insectos en le patio dell Instituto.

Una de las muestras obtenidas.: insecto con elementos del ambiente para evitar su estrés.

Las muestras colectadas se registraron en bolsas detalladas con fecha, hora y características del lugar donde fueron obtenidas. Además se introdujeron elementos del ambiente como tierra y pequeñas hojas para evitar el estrés de los individuos colectados. Luego de estas colectas, se realizaron experimentos de comportamiento y actividades en el laboratorio junto al Departamento de Genética y Biodiversidad.

Otra micropasantía ocurrió en el Departamento de Genética a cargo de  la investigadora Lucía Canclini, sobre la propuesta: Citoesqueleto al microscopio.

En esta oportunidad 2 estudiantes durante 3 días, realizaron diferentes ensayos de inmunocitoquímica, un área de investigación que estudia la localización microscópica de las proteínas presentes en los tejidos o células. Uno de los objetivos principales de la actividad fue incentivar la discusión crítica de los estudiantes durante todas las jornadas. 

Las y los  jóvenes visualizaron microtúbulos y filamentos de actina, estructuras celulares que le proporcionan forma a las células eucariotas, además de intervenir en diferentes procesos de transporte intracelular de sustancias y complejos moleculares en células en cultivo.  

En la imagen se observa un fibroblasto (un tipo de célula del tejido conectivo) de ratón en cultivo. Está teñido en azul para visualizar el núcleo, en verde para ver los microtúbulos y en rojo los filamentos de actina.

En  el área de Microbiología también hubo al menos una micropasantía en el Departamento de Bioquímica y Genómica Microbianas – IIBCE. El tema central fue la producción de biogás a partir de residuos y el aislamiento de microorganismos que lo hacen posible.

En las fotos siguientes vemos el momento en que tomaban las muestras para sembrar y hacer los aislamientos de bacterias en placas de petri, y luego en la cámara, haciendo la siembra.

Las estudiantes se preparan para tomar las muestras baterianas

Una de las estudiantes con las manos en la masa, sembrando bacterias en placas de cultivo

Otra de las estudiantes trabajando en la cámara de cultivo.

 

IIBCE gana el primer premio del proyecto “Quiero ser científica” de la OWSD Uruguay

El 16 de noviembre dentro del proyecto “Quiero ser científica” del Capítulo uruguayo de la Organización Mundial de Mujeres en la ciencia para el Mundo en Desarrollo (OWSD por sus siglas en inglés), se llevó a cabo un Taller de Proyectos en el edificio Los Ceibos del LATU. Allí se reunieron varias científicas y estudiantes de Bachillerato de liceos públicos de todo el país, para presentar sus proyectos de investigación elaborados con la orientación de las científicas en calidad de mentoras.

El primer premio fue otorgado al grupo “Aracno attack” del Liceo de Treinta y Tres, en el que participaron Jazmín Fleitas, Josefina Catcha y Arantxa y cuyas mentoras fueron Mariángeles Lacava de Centro Universitario de Rivera, María Inés Fariello de la Facultad de Ingeniería y Carmen Viera, investigadora asociada del IIBCE.

Aracno attack ganó el primer premio con el proyecto “Comportamiento predador de las arañas Lycosa thorelli sobre insectos de importancia económica en el arroz, bajo influencia de insecticidas”, en el que evaluaron el efecto de un insecticida utilizado en cultivos de arroz sobre el comportamiento de captura de Lycosa thorelli, una araña frecuente.

Sus resultados preliminares coinciden con la hipótesis a testear en el 2020, ya en el trabajo de campo más profundo, donde las arañas contaminadas con insecticidas mostraron un comportamiento más demorado y complejo para capturar presas que las arañas sin tratar o tratadas con agua destilada.

Lo importante para las estudiantes fue poder demostrar que en presencia del insecticida, las frecuencias y unidades de comportamiento de estas arañas son mayores y más complejas, y los tiempos de captura más largos, y por lo tanto, bajo estas condiciones son menos eficientes en el control de insectos de los cultivos.

¡Muchísimas felicitaciones a todas!

Estudiantes durante el curso 2019 de capacitación en Biofilms.

Rápidos y furiosos. Los biofilms y la investigación para combatir la resistencia antimicrobiana 

En 2019 iniciamos un nuevo proyecto con el apoyo de la Agencia Uruguaya de Cooperación Internacional para capacitar a varias investigadoras del Departamento de Microbiología en el uso de herramientas matemáticas y computacionales microscópicas titulado Capacitaciones en Biofilm: una respuesta para superar las bacterias multirresistentes.

Este conocimiento novedoso e inexistente en Uruguay, se aplica al estudio dinámico, morfológico y topológico de modelos biofísicos, biológicos y médicos. Además de esta capacitación durante el proecyto se procesarán imágenes obtenidas en un Light Sheet Fluorescence Microscopy (LSFM) que tiene incorporado un sistema de pinzas ópticas para la manipulación de distintas muestras. 

La base para este emprendimiento es un convenio de Cooperación Sur- Sur entre el Instituto Milenio de Neurociencia Biomédica (BNI) de Chile y el IIBCE. El BNI desarrolla una importante labor en transferencia de conocimiento y habilidades mediante soluciones tecnológicas que generan valor hacia instituciones tanto públicas como privadas; innovaciones dirigidas a su vez, al desarrollo de un modelo de sustentabilidad económica.

Dentro de los laboratorios que conforman el BNI, se encuentra el Laboratorio de Análisis de Imágenes Científicas (SCIAN-Lab), pionero regional en el desarrollo de estas herramientas microscópicas. Para nuestro Instituto resulta clave poder capacitar investigadores en laboratorios de punta con equipamiento que aún no está disponible en nuestro paí. Por ende, resulta estratégico establecer un intercambio fluido con este laboratorio. 

Una de las líneas de investigación tradicionales del Departamento de Microbiología, se basa en el estudio de bacterias uropatógenas causantes de infecciones urinarias (ITU) en humanos, en particular de los microorganismos Proteus mirabilis y Escherichia coli. Estos 2 microorganismos se encuentran en la lista de los 12 Patógenos prioritarios publicada el 2017 por la Organización Mundial de la Salud, por ser todos organismos muy resistentes a los antimicrobianos. Algunos de estos además tienen la capacidad de producir Biofilms, colonias bacterianas que forman una película que impide aún más la acción de los antibióticos.  

Por esto, es urgente enfocar las investigaciones sobre la generación de resistencia antibiótica y la búsqueda de alternativas para lidiar con ellas.

Paola Scavone, investigadora del IIBCE y coordinadora del proyecto por parte de Uruguay.

Paola Scavone, investigadora del IIBCE y coordinadora del proyecto por parte de Uruguay.

Biopelícula o biofilm de bacterias Proteus mirabilis obtenidas en el microscopio confocal.

Biopelícula o biofilm de bacterias Proteus mirabilis obtenidas en el microscopio confocal.

Respondiendo a este llamado, en los últimos años el Departamento de Microbiología del IIBCE ha incorporado a sus investigaciones el estudio de los biofilms microbianos, pues se ha comprobado que juegan un rol fundamental en el desarrollo de mecanismos asociados a la resistencia antibiótica. En en ésta área que el IIBCe aportará beneficios al 

La OMS ha planteado un plan de acción mundial en resistencia a antimicrobianos, donde se encuentra la necesidad de mejorar la comprensión del tema a través de la investigación científica. Aquí es donde podemos aportar con investigación de primer nivel sobre a formación de biofilms y la búsqueda de nuevas estrategias para controlarlos.

Modelo de flujo utilizado para la formación de biofilms.

Modelo de flujo utilizado para la formación de biofilms.

Es importante mencionar que los biofilms no sólo son un problema de Salud Pública sino también a nivel ambiental, ya que por sus características biofísicas suelen desarrollarse en múltiples superficies y ambientes considerados hostiles, como por ejemplo en sistemas de membranas para desalinización de agua.

Debido a que estas problemáticas son transversales, existe un interés común entre Uruguay y Chile en la búsqueda de soluciones a mediano y largo plazo. Por ello consideramos relevante capacitar a personal en la generación de habilidades para el cultivo y estudio de Biofilms bacterianos y en su manipulación, visualización y cuantificación a través de técnicas microscópicas avanzadas disponibles a nivel regional solamente en BNI- Chile. 

Este proyecto busca también fortalecer la participación y capacitación de mujeres en las áreas STEM (siglas en inglés para Ciencia, Tecnología, Ingeniería y Matemática) ya que la microscopía y el análisis de imágenes ha sido un área principalmente desarrollada por hombres. En nuestro caso, queremos potenciar el desarrollo de esta área por jóvenes científicas en las ramas de la biología, ingeniería, física y microbiología. Además, La temática estudiada por estos dos grupos de investigación (biofilms microbianos-infecciones del tracto urinario) afectan mayoritariamente a mujeres*. 

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*Se estima que el 50% de todas las mujeres experimentarán un episodio de infección urinaria en su vida (Foxman,2003). Entre un 20 al 40% de éstas tendrán un episodio de recurrencia a los 6-12 meses siguientes al primer episodio (Fozman,2000). Los síntomas clínicos de las ITU consisten desde dolor al orinar, aumento de la frecuencia de micción, incontinencia, fiebre, dolor abdominal y lumbar (Gupta,2017).