Cursos 2017_ Filogenia Molecular

Este curso PEDECIBA será del 27 de noviembre al 1 de diciembre en nuestro Instituto, de 8 a 12:30 y de 14 a 18:30.

Entre los contenidos teóricos se verá una introducción a los fundamentos de la sistemática con énfasis en la sistemática molecular; métodos de inferencia filogenética (parsimonia, máxima verosimilitud e inferencia bayesiana), modelos evolutivos, combinación de datos morfológicos y moleculares, delimitación de especies y estimación de tiempos de divergencia.

En las sesiones prácticas se utilizarán programas informáticos para realizar alineamientos, reconstruir filogenias con diferentes métodos, seleccionar modelos evolutivos, estimar tiempos de divergencia y delimitar las especies. Finalmente los estudiantes expondrán los resultados obtenidos a partir del análisis de sus propios datos o los proporcionados por los docentes.

Para inscribirse enviar un mail a Leticia Bidegaray (letigaray@yahoo.com) antes del 15 de noviembre.

Participan los docentes Leticia Bidegaray, IIBCE, Montevideo (Coordinadora); Miquel Arnedo, Universidad de Barcelona, Bracelona, Catalunya (Docente Invitado); Fernando Álvarez, Facultad de Ciencias- UdelaR, Montevideo; Arley Camargo, Centro Universitario de Rivera- UdelaR, Rivera; Andrés Iriarte, Instituto de Higiene, Facultad de Medicina- UdelaR Montevideo; Héctor Romero, Facultad de Ciencias- UdelaR, Montevideo.

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Regenerar la médula espinal

IIBCE lidera un proyecto nuevo con una importante financiación internacional

Nuestro Instituto acaba de recibir financiación internacional de  la prestigiosa fundación Wings for Life Spinal Cord Research Foundation (WFL), para profundizar su investigación sobre la capacidad de autoreparación de la médula espinal.

La fundación WFL ha financiado más de 170 proyectos de investigación de punta a nivel internacional (la mayoría en Estados Unidos y Europa) para promover el conocimiento en distintos aspectos que promuevan el ambicioso objetivo de curar las lesiones espinales. El Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable ha sido el primero en América Latina en recibir su reconocimiento, a través del financiamiento del proyecto Entendiendo la biología de las células madre endógenas para mejorar la auto-reparación de la médula espinal”.

Mapamundi de los países que han recibido financiación de WFL

Mapamundi de los países que han recibido financiación de WFL

Liderado por el Dr. Raúl Russo del Departamento de Neurofisiología Celular y Molecular de nuestro Instituto y destacado recientemente en el portal de la fundación, el proyecto contará con una financiación importante por 3 años. Es un orgullo para nosotros contarles un poco más sobre esta investigación llevada a cabo en un 100% por investigadores uruguayos.

Esquema general del proyecto de investigación sobre el potencial de auto-reparación de la médula espinal.La primera descripción de una lesión de la médula espinal, se encuentra en el papiro de Smith y se atribuye al médico egipcio Imothep en el siglo  XXVI aC. Imothep describió  diversos signos y síntomas de la lesión espinal concluyendo que es “una condición médica que no puede ser curada”. A pesar de los enormes avances de la medicina en muchos campos, la dura sentencia de Imothep sigue siendo válida en nuestros días. La lesión traumática de la médula espinal afecta a alrededor de 2,5 millones de personas en todo el mundo.  Es una lesión que limita en forma dramática la calidad de vida, pues provoca la pérdida de movilidad por debajo de la lesión (cuadriplejía o paraplejía) y el control de las funciones autonómicas.

Uno de los retos de la investigación biomédica es cambiar este panorama. Aunque la médula espinal de los mamíferos carece de la capacidad de autoreparación que poseen otros tejidos como el hígado o la piel, algunas células con características de células madre neurales, salen de su letargo en respuesta a una lesión traumática. Son células que se encuentran en una estructura de la médula espinal llamada canal central o epéndimo. Frente a una lesión en la médula espinal, estos progenitores se dividen generando nuevas células que migran hacia la lesión.

Las células derivadas del epéndimo parecen ser beneficiosas, pues producen factores de crecimiento que ayudan a las neuronas y sus prolongaciones alrededor de la lesión, a sobrevivir. Por lo tanto, optimizar la reacción del epéndimo frente a una lesión, es una estrategia prometedora para alcanzar una reparación endógena, es decir, generada por el propio organismo, para recuperar las funciones perdidas.

Esquema general del proyecto de investigación sobre el potencial de auto-reparación de la médula espinal.

Para alcanzar este objetivo, es vital comprender los mecanismos que regulan el comportamiento de las células madre progenitoras en el canal central. Es posible que la lesión reactive alguno de los programas genéticos vinculados al ensamblaje de la médula espinal durante el desarrollo embrionario. A su vez, la reacción de las células ependimarias y el destino de su progenie, estarían regulados por propiedades intrínsecas específicas y el “entorno químico” producido por el daño del tejido. En este sentido, el ATP, una molécula que además de almacenar energía funciona como transmisor de información en el sistema nervioso, se libera masivamente después de la lesión y es posible que sea un factor clave en la reactivación de las células madre  espinales.

El grupo de investigación que lleva adelante este proyecto en el IIBCE, aplica una aproximación multitécnica y utiliza modelos animales que permiten realizar el seguimiento de las células ependimarias y su descendencia después de una lesión. Combina el uso de la electrofisiología, la transcriptómica (en colaboración con el Dr. F. Álvarez de la Facultad de Ciencias, UdelaR), la inmunohistoquímica y la microscopía electrónica.

El objetivo a largo plazo es revelar pistas que sean útiles para manipular los progenitores espinales y así lograr una reacción más adaptativa a la lesión, que promueva la recuperación de las funciones perdidas.

Compartimos con Uds. también un video que ilustra parte de los conocimientos que llevaron a plantear este proyecto

El video muestra una célula progenitora que posee un proceso con un pie en contacto con la luz del canal central de la médula espinal (esquina inferior izquierda).
La célula está llena con Fluo4, un compuesto que aumenta su fluorescencia cuando aumenta la concentración de calcio intracelular. La secuencia comienza con una imagen que refleja la concentración de calcio en condiciones normales. Cuando se aplica BzATP -un compuesto químico que activa en forma selectiva los receptores para el ATP tipo P2X7-
cerca de la luz del canal, se genera una onda de calcio que se propaga hacia la parte distal del progenitor, invadiendo el cuerpo celular (el momento de la aplicación está indicado por la aparición de la leyenda “puff BzATP”). Esta señalización de calcio intracelular inducida por la activación de receptores P2X7 podría modificar la expresión de genes o estructuras sub-celulares que “activen” a los progenitores iniciando la reacción para reparar la médula espinal. En la escala de pseudocolor, el azul indica una concentración baja de calcio en tanto el amarillo-blanco indica una concentración alta.
Datos obtenidos por Nicolás Marichal.

 

Sobre Wings for Life– Spinal Cord Research Foundation

Fue fundada por el dos veces campeón del mundo de motocross Heinz Kinigadner y el fundador de Red Bull, Dietrich Mateschitz. En 2003, Hannes Kinigadner -hijo de Heinz- tuvo un accidente trágico que le dejó tetraplégico (sin movilidad en los cuatro miembros). Movidos por la terrible lesión de Hannes, Kinigadner y Mateschitz invitaron a científicos de todo el mundo a reunirse en Salzburgo para discutir el problema. A partir de esta reunión se hizo evidente que, contrariamente a la opinión común, hay razones legítimas para creer que la lesión traumática de la médula espinal se pueda curar en un futuro no tan lejano. Los descubrimientos innovadores realizados por el Prof. Dr. Sam David en 1981 y por el Prof. Dr. Martin Schwab a principios de los años 90 mostraron que las células nerviosas lesionadas en la médula espinal tienen cierta capacidad de regenerarse después de tratamientos específicos. Kinigadner y Mateschitz se dieron cuenta de que la investigación científica sobre las lesiones de la médula espinal estaba insuficientemente financiada.  Esto los  llevó a crear la fundación Wings for Life, con el objetivo promover la investigación básica y clínica que lleve al desarrollo de nuevas terapéuticas para curar a las personas afectadas de lesiones espinales. Como reza una frase en el portal de la fundación “La cuestión no es si se encontrará un cura, sino sólo cuándo esto sucederá”.

Jornadas Interdisciplinarias en Biodiversidad y Ecología (III JIBE)

Estas jornadas serán del 28 de noviembre y el 2 de diciembre en la sede del CURE en Rocha.

Extendemos una invitación especial para una sesión donde participará nuestra investigadora Claudia Piccini: “Avances para el monitoreo y gestión de floraciones nocivas en Uruguay”

El principal objetivo de la sesión es generar un espacio para presentar trabajos sobre floraciones nocivas dulceacuícolas (i.e. cianobacterias) y marinas (i.e. dinoflagelados) para buscar abordajes comunes a ambos ambientes. Se espera que se presenten investigaciones básicas y aplicadas sobre estos eventos, con énfasis en el monitoreo, análisis, predicción y gestión de la problemática.

La fecha límite para la recepción de resúmenes es el 30 de setiembre.

Cursos 2016_Métodos moleculares de diagnóstico e identificación aplicados al estudio de microorganismos de interés en salud animal

Este curso de posgrado se realizará del 1 de agosto al 9 de setiembre en nuestro Instituto.
Las inscripciones están abiertas hasta el 26 de julio y realizan en la Bedelía de la Facultad de Ciencias o a través del siguiente correo: posgrado@fvet.edu.uy

El objetivo principal es brindar a estudiantes de posgrado provenientes de diversas áreas del conocimiento biológico las herramientas básicas para el diseño de estrategias moleculares de identificación, diagnóstico y tipificación de microorganismos de interés en salud animal. A su vez, se pretende fomentar la interacción entre los estudiantes de distintas áreas y entre éstos y los docentes participantes, estimulando la generación de ideas y la cooperación científica.

Encontrarán más información en la imagen y en este enlace.

Curso micro patógenos animales 2016

Proyectos IIBCE de Alto Impacto_ METHANOBASE

A través de una convocatoria de la ANII, IIBCE forma parte de un proyecto de 3 años en el que colaboran centros de investigación de varias partes del mundo. Se trata de un proyecto ERANet- LAC, llevado adelante por instituciones de América Latina, el Caribe, y Europa.
El nombre suena tan importante como su objetivo: METHANOBASE, una base de datos sobre las emisiones de metano en un escenario de cambio climático. Específicamente, METHANOBASE buscará obtener información significativa sobre la forma en que algunos microorganismos liberan metano a la atmósfera, en las condiciones actuales, y frente a un aumento de temperatura simulado en el laboratorio.

El metano es uno de los principales gases de efecto invernadero y por ende uno de los responsables del aumento global de la temperatura atmosférica. El objetivo principal del proyecto, entre otros, será evaluar el efecto del aumento de la temperatura en las emisiones de metano en los ambientes fríos. ¿Se van a incrementar o no?

Microorganismos Bioindicadores
Para prevenir perturbaciones ambientales de impacto negativo sobre el planeta, necesitamos evaluar escenarios posibles a futuro. Uno de estos escenarios es la vida en ambientes fríos que ya no lo son tanto. Con METHANOBASE se simulará un aumento de la temperatura, incubado los microorganismos encontrados en estos ambientes a temperaturas por encima de lo habitual. Durante la incubación, se medirá tanto la emisión como el consumo de metano.

¿Quiénes son los protagonistas?
Las arqueas y las bacterias, dos tipos de organismos procariotas, algunos de ellos muy primitivos, responsables de liberar y consumir este gas en nuestro medio.
¿Alguna vez escucharon culpar a las vacas del cambio climático? Ellas no son las responsables directas: tanto las vacas como nosotros tenemos arqueas en nuestro sistema digestivo, y es a través de su propio metabolismo que liberamos este gas. Como cada vez hay más vacas para nuestro consumo de carne, se las culpa de ser las principales generadoras del efecto invernadero*, aunque cuando hablamos sus emisiones de metano, nos referimos a los productos del metabolismo de las arqueas que llevan dentro.

Claudia Etchebehere y Celine Lavergne (francesa trabajando en la Universidad de Valparaíso en Chile)

Claudia Etchebehere, responsable del proyecto por el IIBCE y Celine Lavergne (francesa trabajando en la Universidad de Valparaíso en Chile)

Un proyecto internacional 
En estos tres años que ya comenzaron a correr, se tomarán muestras de 3 lugares del mundo bien alejados: Alaska, Siberia y Punta Arenas. Estos sitios representan los ecosistemas Ártico, Subártico y Subantártico respectivamente y se eligieron porque allí, el suelo pasa una temporada congelado y esto evita que entre oxígeno. Como las arqueas que emiten metano son anaerobias, viven en ausencia de oxígeno, en estos suelos existe mayor capacidad de metabolizarlo. Además, los ambientes fríos son más sensibles a los cambios de temperatura. Otro punto importante es que los 3 sitios tienen un tipo de ecosistema de suelo específico llamado peatland o turbera, donde se acumula materia orgánica favoreciendo el metabolismo. Por último, todos cuentan con laboratorios cerca para procesar las muestras.

ERANet-LAC se lleva a cabo por un consorcio de grupos de investigación: Las Universidades de Valparaíso y Magallanes de Chile, el grupo Ecolab de Toulouse, Francia, donde trabaja la directora, Dr Maialen Barret, el grupo Biodiversity and Evolution Genomics de Bélgica, uno especializado en transcriptómica de la Universidad de Tromso de Noruega, otro de la Universidad Fairbanks de Alaska, el laboratorio de Geocriología de Igarka, Siberia y el IIBCE de Montevideo.
Cada grupo de investigación pondrá su parte para avanzar en el estudio de la estructura de las comunidades microbianas ligadas al metabolismo de metano y su relación con las condiciones ambientales donde viven.

Se realizarán 3 muestreos en total. Uno ya se hizo en Punta Arenas, otro está ocurriendo ahora será en Alaska (junio) y el último en Siberia, en julio y agosto. En cada muestreo, primero se miden las emisiones en el lugar mismo, in situ. Esto es posible gracias a un dispositivo que permite detectar los flujos de gases metano (CH4), CO2 y O2, que se medirán en los suelos cerca de los lagos, en las turberas y en la propia agua.

Armando Sepulveda (mexicano que trabaja en la Universidad de Magallanes en Chile) y Celine.

Armando Sepulveda (mexicano que trabaja en la Universidad de Magallanes en Chile) y Celine, realizando los muestreos.

Además de las mediciones de flujo de gases in situ, se tomarán varias muestras que se llevarán al laboratorio para extraerle su ADN y ARN. El ADN permitirá estudiar qué bacterias y qué arqueas hay, con el gen marcador 16S del ADN ribosomal. Para ver qué pasaría si aumentara la temperatura, será justamente el grupo del IIBCE quien realice la simulación, incubando las muestras con el sustrato adecuado, en este caso Acetato o Hidrógeno. Luego de un tiempo considerable de incubación, de aprox. 100 días, ya que las arqueas metanogénicas crecen lento, se medirá la producción de metano hasta que se acabe el sustrato.

Con los análisis de ADN se verá qué especies fueron favorecidas en ese cambio de temperatura. También se determinarán los genes de una enzima específica de las arqueas y otro gen específico de las bacterias que consumen metano. Esto permitirá cuantificar el porcentaje de estos genes por gramo de suelo y ver cuántos hay de un tipo u otro, el pool genético. Por último, se buscará evaluar qué ambientes tienen más producción o más consumo, si la materia orgánica favorece o desfavorece un proceso u el otro, entre otros aspectos de la ecología microbiana.

Celine y Bruna en el Instituto de Geofisica de la Universidad de Alaska en Fairbanks

Celine y Bruna en el Instituto de Geofisica de la Universidad de Alaska en Fairbanks

Otros aportes del proyecto
Todos los datos del proyecto servirán para aumentar la base mundial de datos sobre la biodiversidad del planeta, a su vez la base de datos de las potenciales funcionalidades de las comunidades de microorganismos. En particular, el grupo de Bélgica que está desarrollando una base de datos georeferenciados de microorganismos de ambientes fríos, aumentará su cobertura. Por ahora se llama mARS, pues la mayor parte de sus datos son de la Antártida; con ERANet-LAC aumentará su base de datos y obtendrá más información para comparar la ecología de las especies con sus respectivos ambientes.

Para este proyecto, en el IIBCE se hizo un llamado a un cargo de posdoctorado. Se presentaron 8 candidatos de varias partes del mundo como Alemania, Brasil y Francia. Finalmente fue una Brasilera, Bruna Dellagnezze, quien vino instalarse a nuestro Instituto por un año para llevar adelante su parte del proyecto.

ERANet-LAC es un gran avance para nuestra ciencia y la de todo el mundo. Es un proyecto IIBCE de Alto Impacto, no sólo local. Además de contribuir al conocimiento global de nuestro plantea en constante cambio, para Uruguay, participar en una investigación de esta escala permitirá acceder a técnicas y tecnologías modernas que no existen en nuestro país, además de intercambiar abordajes y conocimientos de frontera.

Contacto con la responsable del proyecto en IIBCE: Claudia Etchebehere – cetchebe@gmail.com
Proyecto dentro de los aprobados por el programa ERANet-LAC (pág. 11)

Cursos 2016_Biología de la Conservación. Tópicos y metodologías de estudio

Este curso comienza el 5 de abril y se llevará a cabo los martes de 18 a 21 horas en la Sala Sáez de nuestro Instituto. El objetivo general es capacitar al estudiante en las bases conceptuales de la biología de la conservación y las metodologías de estudio, analizando los aspectos demográficos, genéticos y ecológicos.

Programa

Biología de la Conservación
Diversidad Biológica
Concepto de especie y de unidades de conservación –
Conservación in situ.
Biología de poblaciones pequeñas aspectos demográficos y genéticos

Variabilidad Genética
Arthropoda: un grupo megadiverso y su importancia en la conservación de la biodiversidad
Medicina de la conservación
La investigación biológica y la educación ambiental

Prioridades de Conservación. Selección en base a especies. Como definir áreas de conservación.
Practico: Modelos poblacionales empleando programa Vortex.

Inscripciones a partir del 7 de Marzo en Bedelía Facultad de Ciencias
Fecha límite de inscripción 31 de Marzo de 2016
Cupo para práctico: 15

Luego de inscripto enviar por mail a: sugonza9@yahoo.com con una carta de una carilla explicando la motivación a realizar el curso y resumiendo su CV. Si el cupo se excede se seleccionara en base a esta nota.
Tendrán prioridad los estudiantes de PEDECIBA

Coordinadora: Dra. Susana González
Docentes: Dr. Enrique Morelli & Dr. Miguel Simó
Docentes colaboradores: Dra. Mariana Cosse, Dra. Claudia Elizondo, Mag. Natalia Mannise

IIBCE de Alto Impacto_Conferencias informativas de interés general

La Sociedad Uruguaya de Microbiología (SUM) los invita a participar de la primera edición del ciclo de conferencias informativas “Patógenos emergentes y su vinculación con el cambio global“.

La primera jornada tratará sobre los virus Zika, Dengue y Chikungunya.

Será jueves 25 de febrero a las 17:30 h en el salón de actos del Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (Avda. Italia 3318).

La entrada es libre y gratuita.

Patógenos emergentes y su vinculación con el cambio global. Ciclos de charlas SUM_001

Programa:
17:30-17:40: Bienvenida: Dra. Claudia Piccini (SUM)
17:40 – 18:00: “Virología de Zika, Dengue y Chikungunya” Dr. Juan Arbiza/ Dra. Adriana Delfraro. Sección Virología, Facultad de Ciencias, UdelaR
18:00 – 18: 20: “Biología del vector” Dra. Gabriela Willat. Unidad de Zoonosis, Ministerio de Salud Pública.
18:20 – 18:40: Pausa para café
18:40 – 19:00: “Prevención, diagnóstico y políticas oficiales”. Dr. Héctor Chipparelli. Departamento de Laboratorios Ministerio de Salud Pública
19:00: Preguntas del público
19:30: Cierre de la actividad

Dada la importancia de la temáticas abordadas, les agradecemos la máxima difusión posible del evento.

Los esperamos

Comisión Directiva
Sociedad Uruguaya de Microbiología