Cursos_ Transferencia horizontal de material genético en bacterias

Este curso se desarrollará del 9 al 18 de octubre en nuestro Instituto y está dirigido a estudiantes de postgrado e investigadores que deseen profundizar sus conocimientos en temas relacionados con la transferencia horizontal de genes en bacterias. En particular está dirigido a profundizar la temática de dos elementos: integrones (en área clínica y ambiental) y plásmidos.

Aquí se puede ver el programa, que incluye jornadas de teóricos, prácticos y seminarios.Curso IIBCE 2017_ Transferencia horizontal de genes en bacterias Por mayor información escribir a Silvia Batista sbatista@iibce.edu.uy Carolina Márquez cmarquezvill@gmail.com o Verónica Antelo veronicaantelo@gmail.com

 

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Cursos 2017_Epidemiologia molecular y genética de enfermedades complejas

Este curso se desarrollará en nuestro Instituto del 28 de abril al 8 de mayo. Constará de clases teóricas, trabajos prácticos y seminarios, más un examen final. Las clases serán de lunes a viernes de 10 a 17 h.

La asistencia a las clases prácticas es obligatoria y los estudiantes de Maestría necesitarán un 75% de asistencia a las clases teóricas para aprobar.

Docente: Dra. Janet Trujillo
Coordinadora: Adriana Mimbacas

Temario del curso

  1. Definición epidemiologia molecular y genética. Tipos de biomarcadores. Criterio de selección, fuentes de variabilidad y validación de biomarcadores. Biomarcadores de exposición, enfermedad y susceptibilidad. Cualidad de datos en genética (errores de genotipificación). Ejemplos de biomarcadores en Diabetes y enfermedades cardiovasculares.
  2. Uso e importancia de biorepositorios y biobancos en epidemiológica molecular y genética. Tipos de especímenes biológicos. Cuidados en la formación de biobancos y criterios de calidad. Ejemplos de biobancos en el estudio de enfermedades complejas.
  3. Tipos de estudios epidemiológicos: cohorte, caso-control, caso-control anidado en la cohorte, caso-cohorte y solo casos. Definición de fenotipos, rasgos cuantitativos y medidas de desenlace. Aplicaciones en epidemiologia molecular y genética.
  4. Métodos estadísticos en epidemiologia molecular. Sensibilidad, especificidad, puntos de corte y curvas ROC.
  5. Estudios de asociación genética en individuos no relacionados.  Tipos de modelos genéticos. Equilibrio de Hardy-Weinberg. Desequilibrio de ligamiento. Estimación de Odds ratio e riesgo relativo brutos y ajustados por covariables. Interacción gen y ambiente. Estudios de asociación de barrido genómico. Haplotipos.
  6. Fuentes de sesgo y confundimiento en estudios de asociación. Estratificación de la población. Control genómico. Uso de marcadores de ancestría en estudios de asociación. Causalidad. Randomización mendeliana. Poder y tamaño de muestra del estudio.
  7. Revisión sistemática y Meta-análisis de estudios de asociación genética y molecular. Sesgo de publicación. Fuentes de heterogeneidad entre los estudios. Ejemplos en enfermedades complejas.
  8. Estudios de asociación genéticos basados en familias. Test de desequilibrio de transmisión. Trios.
  9. Reporte de estudios epidemiológicos y de asociación genética (STREGA). Análisis crítico de los estudios de asociación en biomarcadores.

El IIBCE por sus protagonistas

Éste es el IIBCE, un instituto de investigación donde trabajan jóvenes científicos en diferentes etapas de formación, con investigadores consolidados de primer nivel, en distintas áreas de la Biología.

Vocación, dedicación, diversidad y calidad. Investigación uruguaya con proyección internacional, en la frontera del conocimiento.

IIBCE, pasión por la ciencia

 

Cursos 2016_Biología de la Conservación. Tópicos y metodologías de estudio

Este curso comienza el 5 de abril y se llevará a cabo los martes de 18 a 21 horas en la Sala Sáez de nuestro Instituto. El objetivo general es capacitar al estudiante en las bases conceptuales de la biología de la conservación y las metodologías de estudio, analizando los aspectos demográficos, genéticos y ecológicos.

Programa

Biología de la Conservación
Diversidad Biológica
Concepto de especie y de unidades de conservación –
Conservación in situ.
Biología de poblaciones pequeñas aspectos demográficos y genéticos

Variabilidad Genética
Arthropoda: un grupo megadiverso y su importancia en la conservación de la biodiversidad
Medicina de la conservación
La investigación biológica y la educación ambiental

Prioridades de Conservación. Selección en base a especies. Como definir áreas de conservación.
Practico: Modelos poblacionales empleando programa Vortex.

Inscripciones a partir del 7 de Marzo en Bedelía Facultad de Ciencias
Fecha límite de inscripción 31 de Marzo de 2016
Cupo para práctico: 15

Luego de inscripto enviar por mail a: sugonza9@yahoo.com con una carta de una carilla explicando la motivación a realizar el curso y resumiendo su CV. Si el cupo se excede se seleccionara en base a esta nota.
Tendrán prioridad los estudiantes de PEDECIBA

Coordinadora: Dra. Susana González
Docentes: Dr. Enrique Morelli & Dr. Miguel Simó
Docentes colaboradores: Dra. Mariana Cosse, Dra. Claudia Elizondo, Mag. Natalia Mannise

Publicaciones IIBCE de Alto Impacto_La genómica del Chagas

La enfermedad de Chagas es un mal que afecta a millones de personas en Latinoamérica y para la cual aún no existen métodos efectivos de prevención, vacunas o agentes químicos terapéuticos adecuados para tratar las fases crónicas de la infección. La causa un organismo unicelular llamado Tripanomosa Cruzi, cuyo ciclo de vida es complejo, con varios estadios de desarrollo y grandes diferencias con otros organismos eucariotas en cuanto a sus mecanismos moleculares básicos de funcionamiento.

Para poder prevenir la infección o incluso controlar la enfermedad, necesitamos conocer bien estos ciclos y saber qué ocurre en cada etapa; por eso, descubrirlo a nivel genético en gran escala, es decir, a nivel genómico, puede ser clave. Con este fin, en el departamento de Genómica del IIBCE dirigido por el investigador José Sotelo Silveira, utilizaron metodologías novedosas para determinar los niveles de producción de casi las 10.000 proteínas del parásito en distintos estadios vitales.

Con la técnica Ribo-seq por ejemplo, secuenciaron millones de fragmentos de ARN mensajeros cuando estaban siendo traducidos a proteínas, lo que les permitió observar cuáles cambian sus niveles de producción cuando el parásito se prepara para la infección del hospedero mamífero, entre ellos el humano.

Los resultados fueron publicados en la revista de acceso abierto BMC Genomics y permiten comprender mejor uno de los puntos a considerar para el diseño de estrategias de control de la enfermedad: la formación de proteínas durante la diferenciación de 2 de los estadios vitales, uno de los cuales está especializado en la infección inicial.

Este trabajo es fruto de la colaboración interdisciplinaria con colegas del Instituto Carlos Chagas-Fiocruz de Curitiba Brasil y la Facultad de Ciencias del Uruguay y tiene un alto interés académico, que se evidencia por la gran cantidad de visitas y descargas desde que fue publicado, el 9 de junio de 2015.

Una vez, más IIBCE aporta conocimiento original para el progreso de la ciencia a nivel nacional e internacional y para beneficio de todos. Felicitamos públicamente a José y sus colegas y les dejamos el acceso a todos quienes estén interesados en leer el trabajo completo, por ahora sólo disponible en inglés.

 

Contacto con José Sotelo Silveira: jsotelosilveira@iibce.edu.uy // sotelojos@gmail.com

Eventos 2015_ DEBATE sobre Organismos Genéticamente Modificados

En el marco de los 10 años de la Semana de la Ciencia y la Tecnología, el Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable se complace en invitarlos al DEBATE​ ​Transgénicos en Uruguay: Oportunidades, riesgos y desafíos​,​ este jueves 28 de mayo a las 18:30 en el salón de actos del IIBCE.​

El debate consistirá en una presentación del tema por científicos y políticos involucrados en la temática​. La modalidad será un primer momento para las presentaciones de aprox.​ ​
15 minutos cada una​ y un​ espacio para preguntas por parte del público e intercambio de opiniones.

Los participantes confirmados son las Dra. Inés Ponce de León del IIBCE, el Dr. Claudio​ ​
Ma​r​tínez Debat de la Facultad de Ciencias​-UdelaR​,​ la Dra. Claudia Piccini del IIBCE y el Ministro interino de ganadería, Enzo Benech.

​Previo al debate brindaremos un café de bienvenida.

​Esperamos contar con su presencia y les agradecemos la máxima difusión posible del evento.

DEBATE TRANSGENICOS

IIBCE en el Mundo

El portal Research Gate permite a las instituciones que realizan investigación, y por ende, publicaciones en revistas científicas arbitradas, visualizar sus colaboraciones a nivel internacional. Aqui está el mapa de investigación del IIBCE, según Reseach Gate.

Colaboraciones de investigadores del IIBCE con otros investigadores del mundo

Colaboraciones de investigadores del IIBCE con otros investigadores del mundo